@MASTERSTHESIS{ 2020:745785853,
 	title = {Identificação de genes associados à epifisiólise proximal do fêmur por meio da análise do transcriptoma da cartilagem em frangos de corte},
 	year = {2020},
 	url = "http://tede.unicentro.br:8080/jspui/handle/jspui/1789",
 	abstract = "Na atual indústria avícola, os problemas locomotores estão entre os principais, causando grandes perdas econômicas e afetando o bem-estar animal. Entre as anomalias ósseas, as mais frequentes no fêmur são a discondroplasia, a epifisiólise ou separação da cabeça do fêmur e a Condronecrose Bacteriana com Osteomielite (BCO), também descrita como Necrose da Cabeça do Fêmur (NCF). No presente trabalho, objetivou-se identificar os genes diferencialmente expressos na cartilagem articular de frangos de corte normais e acometidos por epifisiólise proximal do fêmur por meio da análise de RNA-Seq. Para isso, um total de oito frangos de corte comerciais com 35 dias de idade foram utilizados, sendo quatro normais e quatro afetados com epifisiólise na cabeça do fêmur. Após a extração do RNA da cartilagem articular (CA), foram construídas as bibliotecas de cDNA para o sequenciamento total do RNA com a plataforma Illumina, seguindo um protocolo paired-end. As sequências que passaram pelo controle de qualidade no programa Seqy-Clean foram mapeadas com o genoma de referência da galinha (Gallus gallus, assembly GRCg6a) usando a ferramenta STAR. Em seguida, os genes diferencialmente expressos (DE) entre o grupo normal e afetado foram determinados usando o pacote edgeR do R considerando False Discovery Rate (FDR) ≤0.05 . Na análise do transcriptoma, 12.169 genes apresentam-se expressos na cartilagem articular do fêmur. Destes, 107 genes foram DE, dos quais 9 foram menos expressos e 98 foram superexpressos no grupo afetado em relação ao grupo normal. Para validação, a expressão relativa de 10 genes foi avaliada. O RNA total do tecido da CA foi isolado de amostras de 10 frangos de corte normais e 10 afetados com epifisiólise. Para a análise de qPCR, um conjunto de 10 genes referência foi avaliado quanto a sua estabilidade para uso como genes normalizadores sendo que os genes constitutivos utilizados foram RPL5 (Proteína Ribossomal L5) e RPLP1 (Subunidade Lateral do Stalk Proteína Ribossômica P1), que foram considerados os mais estáveis. Dos 10 genes avaliados, 6 foram validados: AVBD1, AVBD2, ANK1, ADA, EPX, RHAG, sendo mais expressos em frangos de corte afetados pela epifisiólise. Na análise funcional, utilizando o conjunto de genes DE do transcriptoma, 79 processos biológicos (PB) foram identificados na base DAVID, sendo agrupados em 12 macrobioprocessos com a ferramenta REViGO. Os principais PB encontrados estavam envolvidos na resposta ao estímulo biótico, transporte de gás, ativação celular, catabolismo de derivados de carboidratos, regulação de múltiplos organismos, sistema imunológico, contração muscular, processo de múltiplos organismos, citólise, leucócitos e adesão entre células. Entre os genes potencialmente desencadeadores da epifisiólise podem ser destacados: a proteína induzível pelo interferon alfa 6 (IFI6), adenosina desaminase (ADA), cathelicidin-3 (CATH3), beta defensina aviária 1 (AVBD1), beta defesina aviária 2 (AvBD2), ankirina 1 (ANK 1), quimiotaxina derivada de células leucocitárias 2 (LECT2) e colágeno tipo XII cadeia alfa 1 (COL13A1). Desta forma, neste estudo foi gerado o primeiro transcriptoma da cartilagem articular de frangos possibilitando identificar um conjunto de genes candidatos a desencadear alterações na placa de crescimento do fêmur.",
 	publisher = {Universidade Estadual do Centro-Oeste},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Medicina Veterinária (Mestrado)},
 	note = {Unicentro::Departamento de Medicina Veterinária}
}