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Tipo do documento: Dissertação
Título: ESTRUTURA GENÉTICA-POPULACIONAL DA PLANTA MEDICINAL Achyrocline flaccida (Weinm.) DC. BASEADA EM MARCADORES ISSR
Título(s) alternativo(s): Genetic population structure of the medicinal plant Achyrocline flaccida (Weinm.) DC. based on ISSR markers
Autor: Rosa, Juliana da 
Primeiro orientador: Silva, Paulo Roberto da
Resumo: A Mata Atlântica possui alta diversidade vegetal devido as suas diversas fitofisionomias. Dentre estas formações vegetacionais, no sul do Brasil destacam-se os Campos. Apesar da importância da Mata Atlântica e suas fisionomias, estudos genéticos com plantas deste Bioma são insuficientes. Achyrocline flaccida (Weinm.) DC., conhecida popularmente como Macela, é uma planta nativa dos Campos da Mata Atlântica que, apesar de sua importância ecológica e medicinal, não possui nenhum dado genético na literatura. Atualmente, os marcadores moleculares são a ferramenta mais indicada para obtenção de dados genético-populacionais. Na literatura são descritos diversos primers ISSR (Inter-simple Sequence Repeat), porém para obtenção de dados confiáveis e com economia de recursos é necessária a utilização de primers robustos para a espécie em estudo. Assim, o objetivo desse estudo foi selecionar os melhores primers ISSR para estudos genéticos em Achyrocline flaccida e avaliar a diversidade e estrutura genética de populações desta espécie oriundas da região sul do Brasil. Para seleção de primers ISSR foram testados 42 primers em uma população de 20 indivíduos e para cada primer foram calculados os seguintes atributos: Conteúdo de Informação de Polimorfismo (PIC), Ándice do Marcador (IM) e Poder de Resolução (RP). Dentre os 42 primers testados, 35 apresentaram amplificação e dentre estes, com base nos resultados obtidos com os índices PIC, MI e RP, foram selecionados os 10 melhores primers para a espécie. Com estes primers foram avaliadas, quanto à diversidade e estrutura genética, sete populações (131 indivíduos) de Macela oriundas do sul do Brasil. A AMOVA evidenciou maior variabilidade genética dentro (64,7) do que entre (33,96) as populações, estando a variabilidade distribuída desigualmente entre as populações (Fst 0,33). O fluxo gênico entre as populações variou de 5,2 a 1,68, sendo de 1,39 para todas as populações. A avaliação do agrupamento de locos, assim como os dados de presença e ausência exclusiva de locos, revela que ausências exclusivas podem estar contribuindo significativamente para a diferenciação das populações. O teste de Mantel indicou correlação positiva entre distância genética e geográfica. Quanto à análise de PCoA, os dados do agrupamento com base na distância genética de Nei e análise Bayesiana corroboram evidenciando fraca estruturação entre as populações e confirmam os altos níveis de fluxo gênico entre as populações. Estes resultados evidenciam alta diversidade genética na espécie. A diversidade entre as populações, a estruturação e o fluxo gênico entre as populações de Achyrocline flaccida, indicam que ocorre e/ou ocorreu intenso fluxo gênico entre as populações do sul do Brasil. Provavelmente este fluxo gênico é potencializado pela ação antropica. Os dados aqui obtidos poderão ser importantes para o entendimento das bases genéticas da espécie e para elaboração de estratégias de conservação e/ou exploração racional da mesma.
Abstract: The Atlantic Forest has a high plant diversity due to its various vegetation types. Among these vegetation formations in southern Brazil highlights the "Campos". Despite the importance of the Atlantic Forest and their vegetation types, genetic studies with plants of this biome are insufficient. Achyrocline flaccida (Weinm.) DC., popularly known as Macela, is a native plant of the grasslands that despite their ecological and medicinal importance, has no genetic data in the literature. Currently, the molecular markers is the most appropriate tool for obtaining genetic-population data. In the literature many ISSR primers (Inter-simple Sequence Repeat) are available. But, to obtain reliable data and with resource savings is necessary to use robust primers for the species under study. The objective of this study was to select the best ISSR primers for genetic studies in Achyrocline flaccida and assess the diversity and genetic structure of populations of this species from southern Brazil. To selection of ISSR primers were tested 42 primers in a population of 20 plants and for each primer was calculated the following attributes: Polymorphism Information Content (PIC), Marker Index (MI) and Resolution Power (RP). Among the 42 ISSR primers tested, 35 showed amplification and of these, based on the results obtained with the index PIC, MI and RP were selected the top 10 primers for the species. With these primers were evaluated the genetic diversity and structure of seven Macela populations (131 samples) from southern Brazil. The AMOVA showed greater genetic variability in (64.7) than between populations (33.96), with the variability unevenly distributed among populations (Fst 0.33). Gene flow between populations ranged from 5.2 to 1.68, being 1.39 for all populations. The evaluation of the loci grouping, as well as the data of presence and absence of exclusive loci reveals that exclusive absences may be contributing significantly to the differentiation of populations. The Mantel test indicated a positive correlation between genetic and geographic distance. The PCoA analysis, the of data of grouping loci, the Nei genetic distance and Bayesian analysis corroborate showing weak structuring among populations and confirm the high levels of gene flow between populations. These results show high genetic diversity in the species. The diversity among populations, the structure and gene flow between the populations of Achyrocline flaccida indicate that it occurs and / or there is a high gene flow among populations of southern Brazil. Probably this gene flow is increased by the anthropic action. The data obtained here may be important for understanding the genetic basis of species and development of conservation strategies and / or rational exploitation of the species.
Palavras-chave: Mata Atlântica
Asteraceae
Gnaphaliae
Macela
Fluxo gênico
Campos sulinos
Atlantic Forest
Asteraceae
Gnaphaliae
Macela
Gene flow
Campos sulinos
Área(s) do CNPq: CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
Idioma: por
País: BR
Instituição: UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro Oeste
Sigla da instituição: UNICENTRO
Departamento: Unicentro::Departamento de Biologia
Programa: Programa de Pós-Graduação em Biologia Evolutiva (Mestrado)
Citação: ROSA, Juliana da. Genetic population structure of the medicinal plant Achyrocline flaccida (Weinm.) DC. based on ISSR markers. 2015. 60 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Evolutiva) - UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro Oeste, Guarapuava, 2015.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
URI: http://localhost:8080/tede/handle/tede/399
Data de defesa: 10-Feb-2015
Appears in Collections:Programa de Pós-Graduação em Biologia Evolutiva

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