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Tipo do documento: Dissertação
Título: SELEÇÃO DE PRIMERS ISSR E ESTRUTURA GENÉTICA POPULACIONAL DE Baccharis crispa SPRENG. (ASTERACEAE) DO SUL DO BRASIL
Título(s) alternativo(s): ISSR primers screening and population genetic structure of Baccharis crispa Spreng. (Asteraceae) from southern Brazil
Autor: Górski, Felipe 
Primeiro orientador: Silva, Paulo Roberto da
Resumo: Baccharis crispa Spreng., popularmente conhecida como carqueja, é uma espécie herbácea pertencente a família Asteraceae. A espécie é amplamente utilizada na medicina popular e na indústria cervejeira como substituto do lúpulo. Também possui importância ecológica, pois é uma planta pioneira e atua na manutenção de polinizadores. Considerando estes aspectos, B. crispa foi selecionada como uma espécie prioritária para realização de estudos de conservação de recursos genéticos e manejo, no bioma Mata Atlântica pelo Ministério do Meio Ambiente. Apesar de tal importância, nada é conhecido da diversidade genética da espécie. Assim, este trabalho teve como objetivo a seleção de primers ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) e análise da estrutura genética de populações da Carqueja oriundas do Sul do Brasil. Para a seleção de primers ISSR, foram avaliados 42 primers em uma população de 20 indivíduos. Para cada primer foi calculado os índices PIC (Conteúdo de Informação Polimórfica), MI (Ándice do Marcador) e RP (Poder de Resolução). Os valores de PIC variaram de 0,27 a 0,45, de MI de 4,87 a 12,37 e de RP de 2,2 e 11,57. Com estes dados foram selecionados os 15 primers com os maiores valores para os três índices. Estes primers foram aplicados em seis populações de B. crispa oriundas dos estados do PR, SC e RS para obtenção de dados genéticos-populacionais da espécie. A similaridade genética média dentro de cada população variou de 0,27 a 0,54 com média de 0,20 para todas as populações, evidenciando alta variabilidade. A análise de variância molecular (AMOVA) mostrou que a maior variação ocorre dentro das populações (0,56) do que entre as populações (0,43), o que é esperado em populações de plantas alógamas. O índice de diversidade de Shannon (0,26) e a diversidade genética de Nei (0,41) demonstram também alta variabilidade genética nas populações. O agrupamento dos indivíduos pelo coeficiente de Jaccard utilizando o método UPGMA formou seis grupos, ou seja, separando cada uma das populações. O teste de Mantel apresentou correlação positiva (r = 0,59) entre a distância geográfica e a distância genética. O índice de fixação (Fst) foi de 0,43. O dendrograma, a correlação e o Fst observado mostram que as populações estão estruturadas. O padrão da distribuição de locos mostrou que a populações do Paraná e Santa Catarina, apresentam maior variabilidade, corroborando com os índices de diversidade calculados. A análise conjunta dos resultados mostra que há alta variabilidade genética em B. crispa e que as regiões do Centro-Sul do Paraná (Região de Guarapuava e General Carneiro) e Meio-Oeste de Santa Catarina (Região de Joaçaba e Campos Novos) são prováveis centros de diversidade da espécie. Os dados observados parecem ainda indicar que a transformação de floresta em pastagens favorece a espécie e quando a floresta é substituída por áreas agrícolas, desfavorece a espécie. Estes dados são inéditos para B. crispa e contribuirão para a compreensão dos aspectos evolutivos da espécie e para o desenvolvimento de estratégias para o cultivo sustentável e conservação da mesma.
Abstract: Baccharis crispa Spreng., popularly known as "carqueja", is a herbaceous species of the Asteraceae family. The species is widely used in folk medicine is also used in brewery as a substitute for hops. Also has ecological importance because it is a pioneering plant and operates in the maintenance of pollinators. Considering these aspects, B. crispa was selected as a priority species for study management and conservation in the Atlantic Forest biome by Brazilian Government. Despite this, little is known about genetic diversity of the species. Thus, this study aimed to the selection of primers ISSR (inter simple sequence repeat) and analysis of populations genetic structure of the Carqueja from the South of Brazil. For the ISSR primers screening, 42 primers were evaluated in a population of 20 individuals. For each primer the PIC (Polymorphic information Content), MI (Index Marker Index) and RP (Resolution Power) indices were calculated. PIC values ranged from 0.27 to 0.45, from 4.87 to 12.37 MI and RP 2.2 and 11.57. With these data we selected 15 primers with the highest values for all three indexes. These primers were run on seven populations of B. crispa derived from the states of Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul. With the ISSR data several genetic index were measured for the studied populations. The average genetic similarity within each population ranged from 0.27 to 0.54 with an average of 0.20 for all populations, showing high variability. The analysis of molecular variance (AMOVA) showed that most variation occurs within populations (0.56) than among populations (0.43), which is expected in allogamic plant populations. The Shannon diversity index (0.26) and Nei`s genetic diversity (0.41) also shows high genetic variability in populations. The grouping of individuals by Jaccard coefficient using UPGMA formed seven groups, corroborating the number of populations. The Mantel test showed a positive correlation (r = 0.44) between geographic distance and genetic distance. The fixation index (Fst) was 0.43. The clustering, correlation and the observed Fst shows that the populations are structured. The pattern distribution of locos showed that the populations of Parana and Santa Catarina, exhibit more variability, confirming the diversity index calculated. The joint analysis of the results shows that there is high genetic varibility in B. crispa and that regions of the Middle-South Paraná (Guarapuava and General Carneiro Region) and Middlewest of Santa Catarina (Joaçaba and Campos Novos Region) are centers of species diversity. The observed data still seem to indicate that the conversion of forest to pasture favors the species and when in agricultural areas, disadvantages the species. These data are novel to B. crispa and will going to contribute to the understanding of the evolutionary aspects of the species and the development of strategies for the sustainable cultivation and conservation of this species.
Palavras-chave: Carqueja
Diversidade genética
Genética de Populações
Marcador Molecular
Mata Atlântica
Carqueja
Genetic Diversity
Population Genetics
Molecular Markers
Atlantic Forest
Área(s) do CNPq: CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
Idioma: por
País: BR
Instituição: UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro Oeste
Sigla da instituição: UNICENTRO
Departamento: Unicentro::Departamento de Biologia
Programa: Programa de Pós-Graduação em Biologia Evolutiva (Mestrado)
Citação: GÓRSKI, Felipe. ISSR primers screening and population genetic structure of Baccharis crispa Spreng. (Asteraceae) from southern Brazil. 2015. 59 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Evolutiva) - UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro Oeste, Guarapuava, 2015.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
URI: http://localhost:8080/tede/handle/tede/396
Data de defesa: 27-Feb-2015
Appears in Collections:Programa de Pós-Graduação em Biologia Evolutiva

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